Ekosistēma ir kopiena, kas ievietota noteiktā vidē un kurā aktīvi dzīvo līdzās esošās būtnes. Tikmēr ūdens ekosistēma ir tāda, kas pastāv ūdenī, tāpēc tās dzīvās sastāvdaļas, veģetācija un dzīvnieki pastāv līdzās un attīstās pašā ūdenī .

Uz mūsu planētas ir divu veidu ūdens: sāļš (okeāni un jūras) un saldais (ezeri, upes, strauti, lagūnas, cita starpā), tāpēc dzīvniekiem un augiem, kas dzīvo vienā no šiem diviem veidiem, ir dabiskas īpašības kas viņiem ļaus pastāvēt apstākļos, kas valda minētajās ūdens ekosistēmās.

Dzīvniekam, kas pielāgots dzīvei sālsūdenī, nebūs tas pats, kas pielāgojas pilnīgi atšķirīgajiem apstākļiem, kas rodas saldajā. Gadījumos, kad pielāgošanās pārmaiņām neeksistē, sugas bieži izzūd.

Jebkurai ekosistēmai jādzīvo divu veidu elementos - biotiskos (ar dzīvību) un abiotiskos (bez dzīvības), kuru efektīva savstarpēja saistība veicinās attiecīgās ekosistēmas līdzsvaru un iztiku.

Starp pirmajiem izceļas dārzeņi, dzīvnieki, sēnītes un baktērijas, biotikai - gaiss, saule, ūdens, klimats un temperatūra.

Kad mēs runājam par mijiedarbību un visu iepriekšējā punktā minēto elementu klātbūtnes nepieciešamību, tas ir saistīts ar faktu, ka viens otram jāuztur un jāattīstās ūdens ekosistēmā.

Tādējādi dārzeņi vai zooplanktons ir pamata ēdiens ļoti mazām zivīm un ūdensdzīvniekiem, piemēram, vaļam, un tajā pašā laikā zooplanktonam ir nepieciešama saules gaismas sniegtā enerģija, lai turpinātu dzīvot. Savukārt mazākās zivis ir ēdiens, kas visvairāk vajadzīgs, un pārējie ūdens augi kalpo arī kā barība sēnītēm un baktērijām, kas atrodas šajā biotopā.

Jāatzīmē, ka ūdens ekosistēmām ir ārkārtīgi liela nozīme dažādu darbību attīstībā, piemēram, lauksaimniecībā, ūdens piegādei personīgajam patēriņam un noteiktu produktu ražošanai. Tomēr mums jāpiemin, ka negodīga un nepilnīga cilvēku rīcība, kas notikusi ūdens piesārņojumā, bieži ir konkrēts un tiešs drauds dzīvības un sugu nepārtrauktībai.